حفاظت اسناد و مدارک طبقه بندی شده:
1- واحد دبیر خانه محرمانه
- تشکیل دبیرخانه محرمانه: انجام کلیه فرآیند تولید، گردش، نگهدار ی اسناد، مکاتبات و ارواق و مدارک طبقه بندی شده دستگاه اجرایی توسط دبیرخانه محرمانه و با نظارت آن مجموعه انجام می شود.
- اجرای کامل آئین نامه حفاظت اسناد و اطلاعات طبقه بندی شده ابلاغی شورای عالی امنیت ملی
- نگهداری و حفاظت کلیدها، کلیدهای قفل ها، رمز ، دستگاههای تکثیر و ... نیز یکی از وظایف دبیرخانه محرمانه است.
2- واحد طرح های حفاظت اسناد
1- تهیه و اجرای طرح های حفاظت اسناد
2- پالایش اسناد راکد:
3- نظارت بر امحاء اسناد و مدارک و اوراق اداری غیر طبقه بندی دستگاه
3- واحد صدور کارت
1- صدور کارت شناسایی و تردد
2- نظارت بر حفاظت اسناد واحدهای تابعه